Terdapat banyak institusi pengajian tinggi di seluruh Kyrgyzstan. Ini termasuk kira-kira tiga puluh tujuh universiti awam dan lapan belas universiti swasta. Universiti terkemuka di Kyrgyzstan ialah Universiti Asia Tengah dan Kyrgyz Universiti Kebangsaan.

Institusi akademik di seluruh dunia menawarkan Sarjana Muda Sains atau Ijazah Sarjana Muda Sains. Ini ijazah sarjana muda popular membantu dalam menyediakan pelajar untuk tempat kerja atau untuk program ijazah lanjutan. Purata BSc mengambil masa tiga hingga lima tahun untuk disiapkan.